Şaşılık ameliyatının süresi uygulanan teknik ve hastanın durumuna bağlı olarak değişkenlik gösterebilir. Şaşılık ameliyatları genellikle 1 ile 3 saat arasında sürer. Ancak bazı özel durumlarda daha kısa veya daha uzun sürebilir.
Şaşılık ameliyatı riskleri arasında ameliyat sonrası gözlerde kayma durumu bulunur. Şaşılık ameliyatından sonra gözlerde hafif bir kayma meydana gelebilir. Şaşılık ameliyatı sonrası tekrar kayma çoğunlukla ameliyat sonrası dönemde görülen normal bir durumdur ve genellikle zamanla düzelir. Ancak bazen özellikle karmaşık şaşılık vakalarında gözlerde kalıcı bir kayma yaşanabilir. Bu tür durumlarda ek tedaviler veya ikinci bir ameliyat gerekebilir. Nadir görülse de bir diğer risk şaşılık ameliyatı sonrası çift görme problemidir. Ameliyatın ardından gözlerin tam olarak hizalanamaması durumunda hastalar iki farklı görüntü algılayabilir. Bu sorun genellikle uyum süreci boyunca kendiliğinden düzelir ya da prizma camlı gözlüklerle tedavi edilebilir.