Lyme hastalığı genellikle ölümcül değildir ancak tedavi edilmediği takdirde ciddi sağlık sorunlarına neden olabilir. Erken teşhis ve uygun tedavi ile hastaların çoğu tamamen iyileşebilir. Ancak, tedavi edilmeyen Lyme hastalığı ilerleyebilir ve kalıcı hasarlara neden olabilir.
Lyme hastalığı semptomları diğer pek çok hastalığa benzeyebildiği için bazen teşhisi zor bir hastalıktır. Bu nedenle Lyme hastalığı, romatoid artrit, fibromiyalji, MS, kronik yorgunluk sendromu gibi rahatsızlıklarla karıştırılabilir. Semptomlarının benzerliği nedeniyle bu hastalıkların yanı sıra depresyon ve anksiyete gibi psikiyatrik problemler de Lyme hastalığı ile karıştırılabilir. Lyme hastalığı şüphesi olan kişilerin mutlaka uzman bir doktora başvurması gerekmektedir.
Lyme hastalığı kendiliğinden geçebilir ancak bu durum nadirdir. Hastalığın tedavi edilmeden bırakılması, kronikleşmesine ve ciddi sonuçlara yol açabilecek komplikasyonların ortaya çıkmasına neden olabilir. Bu nedenle, Lyme hastalığı şüphesi olan kişilerin vakit kaybetmeden bir sağlık uzmanına başvurarak teşhis ve tedavi sürecini başlatmaları önerilir. Tedavi erken dönemde başlatıldığında daha etkili olur ve hastalığın ilerlemesinin önüne geçilebilir.