Beyin sapı hasarının iyileşme süreci hasarın boyutuna ve tedaviye yanıtına bağlı olarak değişiklik gösterebilir. Erken teşhis ve uygun tedavi ile bazı işlevler geri kazanılabilir.
Beyin sapı hastalıkları genellikle nöroloji ve beyin cerrahisi uzmanları tarafından değerlendirilir ve tedavi edilir.
Beyin sapı zarar gördüğünde hayati fonksiyonlar ciddi şekilde etkilenebilir. Solunum durması, kalp ritmi bozuklukları, bilinç kaybı gibi durumlar ortaya çıkabilir. Bu türden hasar acil tıbbi müdahale gerektirir.